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Wenn Dein externes E-Mail Programm mit IMAP statt POP3 installiert wurde dann besteht normal kein Problem da die E-Mail auf dem Mail-Server nicht gelöscht werden.
Der Hauptunterschied ist, dass IMAP E-Mails auf dem Server speichert und zwischen allen Geräten synchronisiert, was den Zugriff von mehreren Geräten ermöglicht. POP3 lädt E-Mails nur auf ein einzelnes Gerät herunter und löscht sie normalerweise vom Server, was die Nutzung nur für ein Gerät sinnvoll macht und zu Datenverlust führen kann, wenn das Gerät ausfällt. IMAP ist daher die modernere und empfohlene Methode, wenn E-Mails auf verschiedenen Geräten (Smartphone, Laptop, PC) abgerufen werden.