Leider sind wir keine Hellseher.
Ohne, dass du uns erklärst, was du wo, wie machst, können wir nur raten. Und das fürt selten zur Lösung.
Was für ein Mailprogramm?
Wie rufst du Mails ab?
Ich empfehle, das Konto neu anzulegen, wenn du nicht per POP3 verbunden hast.
Zus Sicherheit auf Webmail schauen, ob alle Mails da sind.