Ich habe seit Freitag auch Lollipop auf einem Swisscom Galaxy Note 3.
WLAN funktioniert(e) bei mir auch über den Upgrade hinweg. In der Vergangenheit war aber leider zu beobachten (persönlich, andere Nutzer in Foren) dass das Galaxy Note 3 gelegentlich sämtliche assoziierten access points vergisst.
Ich kann als ersten Ansatz nur empfehlen, das Gerät zurückzusetzen: Einstellungen -> Allgemein -> Sichern und zurücksetzen. Dies ermöglicht einen Neuanfang (von dem ich mir erhoffe, dass er dafür sorgt, dass nach dem Upgrade auf Lollipop keine spontanen Reboots mehr auftauchen).
Sollte dies nicht helfen -> Garantie - Swisscom. Die setzen als Erstes übrigens auch das Gerät zurück 😉