Grundsätzlich funktioniert die Fritzbox an einem Swisscom DSL Anschluss.
Bei den Providereinstellungen ist einfach "Swisscom All IP" zu wählen. Damit funktioniert die Box an einem EAP sowie an einem WARP Anschluss.
Was nicht so einfach funktioniert ist die IP Telefonie. Kann man aber umgehen. Am einfachsten indem man die Telefonie nicht mehr von der Swisscom bezieht 🙂

Dein Problem ist aber wirklich der Annex. Dieser muss auf B umgestellt werden.
Ich denke das dies mit rukernel irgendwie möglich ist.
http://rukerneltool.rainerullrich.de/